Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnn1Q08091 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnn1Q08091 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms