Protein–RNA interactions for Protein: Q03395

ROM1, Rod outer segment membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1Q03395 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ROM1Q03395 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ROM1Q03395 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ROM1Q03395 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms