Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
TOP2BQ02880 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
TOP2BQ02880 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
TOP2BQ02880 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
TOP2BQ02880 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
TOP2BQ02880 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
TOP2BQ02880 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
TOP2BQ02880 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
TOP2BQ02880 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
TOP2BQ02880 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
TOP2BQ02880 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
TOP2BQ02880 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
TOP2BQ02880 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
TOP2BQ02880 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
TOP2BQ02880 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
TOP2BQ02880 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
TOP2BQ02880 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
TOP2BQ02880 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
TOP2BQ02880 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
TOP2BQ02880 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
TOP2BQ02880 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
TOP2BQ02880 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
TOP2BQ02880 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
TOP2BQ02880 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
TOP2BQ02880 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
TOP2BQ02880 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
TOP2BQ02880 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
TOP2BQ02880 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
TOP2BQ02880 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
TOP2BQ02880 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
TOP2BQ02880 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
TOP2BQ02880 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
TOP2BQ02880 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
TOP2BQ02880 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.15■■■■□ 3.86
TOP2BQ02880 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
TOP2BQ02880 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
TOP2BQ02880 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
TOP2BQ02880 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
TOP2BQ02880 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
TOP2BQ02880 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
TOP2BQ02880 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
TOP2BQ02880 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
TOP2BQ02880 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
TOP2BQ02880 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
TOP2BQ02880 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
TOP2BQ02880 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC39.12■■■■□ 3.85
TOP2BQ02880 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
TOP2BQ02880 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
TOP2BQ02880 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
TOP2BQ02880 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
TOP2BQ02880 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
TOP2BQ02880 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
TOP2BQ02880 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
TOP2BQ02880 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
TOP2BQ02880 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC39.11■■■■□ 3.85
TOP2BQ02880 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
TOP2BQ02880 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
TOP2BQ02880 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
TOP2BQ02880 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
TOP2BQ02880 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
TOP2BQ02880 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
TOP2BQ02880 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
TOP2BQ02880 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
TOP2BQ02880 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
TOP2BQ02880 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
TOP2BQ02880 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
TOP2BQ02880 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
TOP2BQ02880 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
TOP2BQ02880 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
TOP2BQ02880 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
TOP2BQ02880 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
TOP2BQ02880 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC39.08■■■■□ 3.85
TOP2BQ02880 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
TOP2BQ02880 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
TOP2BQ02880 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
TOP2BQ02880 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.84
TOP2BQ02880 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.84
TOP2BQ02880 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
TOP2BQ02880 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC39.07■■■■□ 3.84
TOP2BQ02880 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.84
TOP2BQ02880 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.84
TOP2BQ02880 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
TOP2BQ02880 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
TOP2BQ02880 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
TOP2BQ02880 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
TOP2BQ02880 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
TOP2BQ02880 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
TOP2BQ02880 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
TOP2BQ02880 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
TOP2BQ02880 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
TOP2BQ02880 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
TOP2BQ02880 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
TOP2BQ02880 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
TOP2BQ02880 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
TOP2BQ02880 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
TOP2BQ02880 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
TOP2BQ02880 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
TOP2BQ02880 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
TOP2BQ02880 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
TOP2BQ02880 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms