Protein–RNA interactions for Protein: P70343

Casp4, Caspase-4, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp4P70343 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Casp4P70343 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casp4P70343 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casp4P70343 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casp4P70343 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casp4P70343 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casp4P70343 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casp4P70343 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Casp4P70343 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casp4P70343 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casp4P70343 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casp4P70343 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casp4P70343 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casp4P70343 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casp4P70343 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casp4P70343 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casp4P70343 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casp4P70343 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casp4P70343 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Casp4P70343 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casp4P70343 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casp4P70343 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casp4P70343 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casp4P70343 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casp4P70343 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casp4P70343 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Casp4P70343 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Casp4P70343 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Casp4P70343 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Casp4P70343 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Casp4P70343 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casp4P70343 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casp4P70343 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casp4P70343 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casp4P70343 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms