Protein–RNA interactions for Protein: P55273

CDKN2D, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2DP55273 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2DP55273 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms