Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FNTAP49354 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FNTAP49354 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FNTAP49354 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FNTAP49354 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FNTAP49354 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNTAP49354 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNTAP49354 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNTAP49354 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNTAP49354 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNTAP49354 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNTAP49354 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNTAP49354 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNTAP49354 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FNTAP49354 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FNTAP49354 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FNTAP49354 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FNTAP49354 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FNTAP49354 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FNTAP49354 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FNTAP49354 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FNTAP49354 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FNTAP49354 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FNTAP49354 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FNTAP49354 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FNTAP49354 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FNTAP49354 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FNTAP49354 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FNTAP49354 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FNTAP49354 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FNTAP49354 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FNTAP49354 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FNTAP49354 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FNTAP49354 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FNTAP49354 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FNTAP49354 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FNTAP49354 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FNTAP49354 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FNTAP49354 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FNTAP49354 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FNTAP49354 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FNTAP49354 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FNTAP49354 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FNTAP49354 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FNTAP49354 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FNTAP49354 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FNTAP49354 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FNTAP49354 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FNTAP49354 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FNTAP49354 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FNTAP49354 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FNTAP49354 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FNTAP49354 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FNTAP49354 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FNTAP49354 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FNTAP49354 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FNTAP49354 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FNTAP49354 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FNTAP49354 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FNTAP49354 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FNTAP49354 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FNTAP49354 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FNTAP49354 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FNTAP49354 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FNTAP49354 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FNTAP49354 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FNTAP49354 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FNTAP49354 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FNTAP49354 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FNTAP49354 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FNTAP49354 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FNTAP49354 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FNTAP49354 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FNTAP49354 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FNTAP49354 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FNTAP49354 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FNTAP49354 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FNTAP49354 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FNTAP49354 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FNTAP49354 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FNTAP49354 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FNTAP49354 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FNTAP49354 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FNTAP49354 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FNTAP49354 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FNTAP49354 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FNTAP49354 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FNTAP49354 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FNTAP49354 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FNTAP49354 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FNTAP49354 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FNTAP49354 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FNTAP49354 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FNTAP49354 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FNTAP49354 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FNTAP49354 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FNTAP49354 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FNTAP49354 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FNTAP49354 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FNTAP49354 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms