Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM23P36406 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM23P36406 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM23P36406 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms