Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXA13P31271 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms