Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-FP30511 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-FP30511 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms