Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
KDM5AP29375 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
KDM5AP29375 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
KDM5AP29375 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
KDM5AP29375 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
KDM5AP29375 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
KDM5AP29375 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
KDM5AP29375 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
KDM5AP29375 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
KDM5AP29375 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
KDM5AP29375 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
KDM5AP29375 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
KDM5AP29375 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
KDM5AP29375 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
KDM5AP29375 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
KDM5AP29375 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
KDM5AP29375 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
KDM5AP29375 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
KDM5AP29375 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
KDM5AP29375 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
KDM5AP29375 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
KDM5AP29375 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
KDM5AP29375 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
KDM5AP29375 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
KDM5AP29375 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
KDM5AP29375 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
KDM5AP29375 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
KDM5AP29375 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC33.56■■■□□ 2.96
KDM5AP29375 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
KDM5AP29375 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
KDM5AP29375 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
KDM5AP29375 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
KDM5AP29375 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
KDM5AP29375 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
KDM5AP29375 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
KDM5AP29375 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM5AP29375 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM5AP29375 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM5AP29375 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM5AP29375 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM5AP29375 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM5AP29375 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM5AP29375 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM5AP29375 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
KDM5AP29375 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
KDM5AP29375 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
KDM5AP29375 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
KDM5AP29375 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
KDM5AP29375 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
KDM5AP29375 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
KDM5AP29375 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
KDM5AP29375 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
KDM5AP29375 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
KDM5AP29375 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
KDM5AP29375 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
KDM5AP29375 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
KDM5AP29375 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
KDM5AP29375 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
KDM5AP29375 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
KDM5AP29375 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
KDM5AP29375 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
KDM5AP29375 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
KDM5AP29375 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
KDM5AP29375 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
KDM5AP29375 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
KDM5AP29375 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
KDM5AP29375 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5AP29375 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5AP29375 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5AP29375 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5AP29375 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5AP29375 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5AP29375 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5AP29375 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5AP29375 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5AP29375 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
KDM5AP29375 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
KDM5AP29375 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
KDM5AP29375 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
KDM5AP29375 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
KDM5AP29375 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
KDM5AP29375 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
KDM5AP29375 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
KDM5AP29375 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
KDM5AP29375 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
KDM5AP29375 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
KDM5AP29375 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
KDM5AP29375 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
KDM5AP29375 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
KDM5AP29375 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
KDM5AP29375 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
KDM5AP29375 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
KDM5AP29375 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
KDM5AP29375 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
KDM5AP29375 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
KDM5AP29375 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.94
KDM5AP29375 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
KDM5AP29375 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
KDM5AP29375 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
KDM5AP29375 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms