Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARID4AP29374 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ARID4AP29374 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARID4AP29374 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARID4AP29374 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARID4AP29374 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARID4AP29374 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARID4AP29374 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID4AP29374 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms