Protein–RNA interactions for Protein: P24043

LAMA2, Laminin subunit alpha-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA2P24043 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMA2P24043 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMA2P24043 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
LAMA2P24043 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMA2P24043 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMA2P24043 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMA2P24043 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMA2P24043 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMA2P24043 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMA2P24043 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA2P24043 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA2P24043 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA2P24043 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA2P24043 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA2P24043 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA2P24043 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA2P24043 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA2P24043 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA2P24043 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA2P24043 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA2P24043 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA2P24043 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA2P24043 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA2P24043 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMA2P24043 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMA2P24043 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMA2P24043 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMA2P24043 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMA2P24043 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMA2P24043 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMA2P24043 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMA2P24043 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMA2P24043 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMA2P24043 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMA2P24043 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMA2P24043 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMA2P24043 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMA2P24043 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMA2P24043 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMA2P24043 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMA2P24043 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMA2P24043 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMA2P24043 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMA2P24043 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMA2P24043 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMA2P24043 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms