Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ATP4AP20648 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP4AP20648 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms