Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT4P19013 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT4P19013 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT4P19013 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT4P19013 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT4P19013 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT4P19013 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT4P19013 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT4P19013 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT4P19013 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT4P19013 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT4P19013 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT4P19013 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT4P19013 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT4P19013 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT4P19013 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT4P19013 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT4P19013 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT4P19013 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT4P19013 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT4P19013 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT4P19013 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT4P19013 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT4P19013 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT4P19013 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT4P19013 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT4P19013 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT4P19013 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT4P19013 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT4P19013 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT4P19013 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT4P19013 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT4P19013 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT4P19013 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT4P19013 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT4P19013 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT4P19013 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT4P19013 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT4P19013 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT4P19013 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT4P19013 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT4P19013 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT4P19013 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT4P19013 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT4P19013 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT4P19013 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT4P19013 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT4P19013 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT4P19013 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT4P19013 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT4P19013 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT4P19013 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT4P19013 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT4P19013 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT4P19013 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT4P19013 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT4P19013 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT4P19013 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT4P19013 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT4P19013 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT4P19013 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT4P19013 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT4P19013 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT4P19013 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT4P19013 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT4P19013 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT4P19013 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT4P19013 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT4P19013 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT4P19013 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT4P19013 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT4P19013 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT4P19013 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT4P19013 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT4P19013 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT4P19013 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT4P19013 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT4P19013 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT4P19013 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT4P19013 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT4P19013 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT4P19013 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT4P19013 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT4P19013 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT4P19013 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT4P19013 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT4P19013 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT4P19013 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT4P19013 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT4P19013 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT4P19013 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT4P19013 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT4P19013 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT4P19013 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT4P19013 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT4P19013 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT4P19013 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT4P19013 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT4P19013 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT4P19013 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms