Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN1P18031 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN1P18031 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN1P18031 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN1P18031 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN1P18031 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN1P18031 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN1P18031 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN1P18031 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN1P18031 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN1P18031 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPN1P18031 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPN1P18031 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN1P18031 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN1P18031 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN1P18031 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN1P18031 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN1P18031 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN1P18031 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN1P18031 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN1P18031 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN1P18031 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN1P18031 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN1P18031 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN1P18031 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN1P18031 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN1P18031 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN1P18031 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN1P18031 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN1P18031 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN1P18031 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN1P18031 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN1P18031 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN1P18031 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN1P18031 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN1P18031 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN1P18031 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN1P18031 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN1P18031 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN1P18031 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN1P18031 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN1P18031 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN1P18031 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN1P18031 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN1P18031 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN1P18031 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN1P18031 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN1P18031 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN1P18031 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms