Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
TOP2AP11388 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
TOP2AP11388 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.19
TOP2AP11388 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
TOP2AP11388 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
TOP2AP11388 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
TOP2AP11388 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
TOP2AP11388 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
TOP2AP11388 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
TOP2AP11388 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
TOP2AP11388 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
TOP2AP11388 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
TOP2AP11388 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
TOP2AP11388 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
TOP2AP11388 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
TOP2AP11388 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
TOP2AP11388 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
TOP2AP11388 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
TOP2AP11388 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
TOP2AP11388 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC41.14■■■■■ 4.18
TOP2AP11388 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC41.14■■■■■ 4.18
TOP2AP11388 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC41.14■■■■■ 4.18
TOP2AP11388 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
TOP2AP11388 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
TOP2AP11388 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
TOP2AP11388 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
TOP2AP11388 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
TOP2AP11388 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
TOP2AP11388 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
TOP2AP11388 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
TOP2AP11388 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
TOP2AP11388 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
TOP2AP11388 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC41.12■■■■■ 4.17
TOP2AP11388 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
TOP2AP11388 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
TOP2AP11388 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
TOP2AP11388 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
TOP2AP11388 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC41.11■■■■■ 4.17
TOP2AP11388 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
TOP2AP11388 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
TOP2AP11388 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
TOP2AP11388 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
TOP2AP11388 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
TOP2AP11388 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
TOP2AP11388 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC41.09■■■■■ 4.17
TOP2AP11388 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
TOP2AP11388 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
TOP2AP11388 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
TOP2AP11388 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
TOP2AP11388 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
TOP2AP11388 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC41.08■■■■■ 4.17
TOP2AP11388 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
TOP2AP11388 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
TOP2AP11388 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
TOP2AP11388 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
TOP2AP11388 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
TOP2AP11388 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
TOP2AP11388 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
TOP2AP11388 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.16
TOP2AP11388 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.16
TOP2AP11388 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC41.06■■■■■ 4.16
TOP2AP11388 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
TOP2AP11388 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
TOP2AP11388 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
TOP2AP11388 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
TOP2AP11388 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
TOP2AP11388 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC41.05■■■■■ 4.16
TOP2AP11388 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
TOP2AP11388 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
TOP2AP11388 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
TOP2AP11388 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
TOP2AP11388 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC41.04■■■■■ 4.16
TOP2AP11388 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
TOP2AP11388 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
TOP2AP11388 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
TOP2AP11388 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
TOP2AP11388 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
TOP2AP11388 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
TOP2AP11388 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
TOP2AP11388 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC41.03■■■■■ 4.16
TOP2AP11388 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
TOP2AP11388 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC41.03■■■■■ 4.16
TOP2AP11388 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
TOP2AP11388 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
TOP2AP11388 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
TOP2AP11388 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
TOP2AP11388 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
TOP2AP11388 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
TOP2AP11388 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.15
TOP2AP11388 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC41■■■■■ 4.15
TOP2AP11388 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
TOP2AP11388 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC41■■■■■ 4.15
TOP2AP11388 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
TOP2AP11388 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
TOP2AP11388 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
TOP2AP11388 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
TOP2AP11388 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
TOP2AP11388 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
TOP2AP11388 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
TOP2AP11388 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 219.8 ms