Protein–RNA interactions for Protein: P0CAP2

POLR2M, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2MP0CAP2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLR2MP0CAP2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLR2MP0CAP2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR2MP0CAP2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR2MP0CAP2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR2MP0CAP2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR2MP0CAP2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR2MP0CAP2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR2MP0CAP2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR2MP0CAP2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR2MP0CAP2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR2MP0CAP2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR2MP0CAP2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR2MP0CAP2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR2MP0CAP2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR2MP0CAP2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR2MP0CAP2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR2MP0CAP2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR2MP0CAP2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR2MP0CAP2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR2MP0CAP2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR2MP0CAP2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR2MP0CAP2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR2MP0CAP2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR2MP0CAP2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR2MP0CAP2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR2MP0CAP2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR2MP0CAP2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR2MP0CAP2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR2MP0CAP2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR2MP0CAP2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR2MP0CAP2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR2MP0CAP2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR2MP0CAP2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR2MP0CAP2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR2MP0CAP2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR2MP0CAP2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR2MP0CAP2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR2MP0CAP2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR2MP0CAP2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR2MP0CAP2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR2MP0CAP2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR2MP0CAP2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR2MP0CAP2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms