Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HOXB7P09629 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms