Protein–RNA interactions for Protein: P06731

CEACAM5, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM5P06731 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CEACAM5P06731 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEACAM5P06731 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEACAM5P06731 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEACAM5P06731 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEACAM5P06731 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEACAM5P06731 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEACAM5P06731 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEACAM5P06731 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEACAM5P06731 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEACAM5P06731 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEACAM5P06731 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEACAM5P06731 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEACAM5P06731 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CEACAM5P06731 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEACAM5P06731 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEACAM5P06731 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEACAM5P06731 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEACAM5P06731 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEACAM5P06731 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEACAM5P06731 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEACAM5P06731 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEACAM5P06731 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEACAM5P06731 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEACAM5P06731 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEACAM5P06731 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEACAM5P06731 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEACAM5P06731 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEACAM5P06731 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEACAM5P06731 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEACAM5P06731 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEACAM5P06731 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEACAM5P06731 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEACAM5P06731 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CEACAM5P06731 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEACAM5P06731 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEACAM5P06731 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEACAM5P06731 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEACAM5P06731 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEACAM5P06731 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEACAM5P06731 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 232.3 ms