Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYBBP04839 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYBBP04839 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYBBP04839 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYBBP04839 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYBBP04839 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYBBP04839 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYBBP04839 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYBBP04839 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYBBP04839 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYBBP04839 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYBBP04839 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYBBP04839 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYBBP04839 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYBBP04839 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYBBP04839 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CYBBP04839 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYBBP04839 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYBBP04839 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYBBP04839 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYBBP04839 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYBBP04839 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CYBBP04839 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CYBBP04839 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYBBP04839 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYBBP04839 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CYBBP04839 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYBBP04839 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYBBP04839 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYBBP04839 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYBBP04839 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYBBP04839 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYBBP04839 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYBBP04839 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYBBP04839 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYBBP04839 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYBBP04839 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYBBP04839 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYBBP04839 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYBBP04839 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYBBP04839 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYBBP04839 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYBBP04839 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYBBP04839 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYBBP04839 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CYBBP04839 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYBBP04839 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYBBP04839 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYBBP04839 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYBBP04839 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYBBP04839 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYBBP04839 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYBBP04839 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYBBP04839 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYBBP04839 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYBBP04839 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYBBP04839 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYBBP04839 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYBBP04839 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYBBP04839 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYBBP04839 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYBBP04839 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYBBP04839 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYBBP04839 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYBBP04839 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYBBP04839 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYBBP04839 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYBBP04839 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CYBBP04839 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYBBP04839 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYBBP04839 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYBBP04839 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYBBP04839 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYBBP04839 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYBBP04839 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYBBP04839 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYBBP04839 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYBBP04839 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYBBP04839 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYBBP04839 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYBBP04839 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYBBP04839 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYBBP04839 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYBBP04839 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYBBP04839 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYBBP04839 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYBBP04839 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYBBP04839 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYBBP04839 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYBBP04839 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYBBP04839 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYBBP04839 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CYBBP04839 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYBBP04839 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYBBP04839 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYBBP04839 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYBBP04839 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYBBP04839 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYBBP04839 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CYBBP04839 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms