Protein–RNA interactions for Protein: O95274

LYPD3, Ly6/PLAUR domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYPD3O95274 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LYPD3O95274 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
LYPD3O95274 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LYPD3O95274 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LYPD3O95274 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LYPD3O95274 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LYPD3O95274 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LYPD3O95274 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
LYPD3O95274 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LYPD3O95274 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LYPD3O95274 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LYPD3O95274 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LYPD3O95274 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LYPD3O95274 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LYPD3O95274 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LYPD3O95274 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LYPD3O95274 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LYPD3O95274 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LYPD3O95274 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LYPD3O95274 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LYPD3O95274 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LYPD3O95274 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LYPD3O95274 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LYPD3O95274 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LYPD3O95274 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LYPD3O95274 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LYPD3O95274 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LYPD3O95274 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LYPD3O95274 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms