Protein–RNA interactions for Protein: O94856

NFASC, Neurofascin, humanhuman

Predictions only

Length 1,347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFASCO94856 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFASCO94856 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFASCO94856 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFASCO94856 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFASCO94856 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFASCO94856 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFASCO94856 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NFASCO94856 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFASCO94856 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFASCO94856 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFASCO94856 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFASCO94856 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFASCO94856 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFASCO94856 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFASCO94856 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFASCO94856 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFASCO94856 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFASCO94856 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFASCO94856 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFASCO94856 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NFASCO94856 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NFASCO94856 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NFASCO94856 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NFASCO94856 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NFASCO94856 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFASCO94856 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFASCO94856 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFASCO94856 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFASCO94856 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFASCO94856 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFASCO94856 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFASCO94856 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFASCO94856 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFASCO94856 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFASCO94856 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFASCO94856 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NFASCO94856 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFASCO94856 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFASCO94856 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFASCO94856 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFASCO94856 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFASCO94856 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFASCO94856 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFASCO94856 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NFASCO94856 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFASCO94856 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFASCO94856 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NFASCO94856 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFASCO94856 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFASCO94856 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFASCO94856 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFASCO94856 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFASCO94856 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFASCO94856 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFASCO94856 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFASCO94856 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NFASCO94856 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFASCO94856 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFASCO94856 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFASCO94856 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFASCO94856 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFASCO94856 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFASCO94856 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFASCO94856 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFASCO94856 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFASCO94856 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFASCO94856 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFASCO94856 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFASCO94856 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NFASCO94856 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NFASCO94856 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NFASCO94856 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NFASCO94856 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NFASCO94856 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NFASCO94856 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NFASCO94856 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NFASCO94856 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NFASCO94856 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NFASCO94856 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NFASCO94856 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NFASCO94856 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NFASCO94856 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NFASCO94856 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NFASCO94856 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFASCO94856 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NFASCO94856 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NFASCO94856 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFASCO94856 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFASCO94856 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFASCO94856 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFASCO94856 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFASCO94856 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFASCO94856 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFASCO94856 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFASCO94856 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFASCO94856 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NFASCO94856 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFASCO94856 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFASCO94856 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFASCO94856 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms