Protein–RNA interactions for Protein: O43278

SPINT1, Kunitz-type protease inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINT1O43278 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPINT1O43278 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPINT1O43278 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPINT1O43278 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPINT1O43278 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPINT1O43278 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPINT1O43278 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPINT1O43278 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPINT1O43278 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPINT1O43278 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPINT1O43278 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SPINT1O43278 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPINT1O43278 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPINT1O43278 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPINT1O43278 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SPINT1O43278 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPINT1O43278 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPINT1O43278 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPINT1O43278 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPINT1O43278 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPINT1O43278 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPINT1O43278 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPINT1O43278 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPINT1O43278 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPINT1O43278 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPINT1O43278 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPINT1O43278 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPINT1O43278 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPINT1O43278 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPINT1O43278 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPINT1O43278 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPINT1O43278 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPINT1O43278 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPINT1O43278 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPINT1O43278 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPINT1O43278 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPINT1O43278 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPINT1O43278 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPINT1O43278 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPINT1O43278 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPINT1O43278 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPINT1O43278 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SPINT1O43278 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPINT1O43278 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms