Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RFXAPO00287 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms