Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vpreb3D3Z6J4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms