Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
C9orf172C9J069 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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