Protein–RNA interactions for Protein: A6NM43

CCT8L1P, Putative T-complex protein 1 subunit theta-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L1PA6NM43 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCT8L1PA6NM43 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT8L1PA6NM43 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms