Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRAMEF22A3QJZ6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRAMEF22A3QJZ6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRAMEF22A3QJZ6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRAMEF22A3QJZ6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRAMEF22A3QJZ6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRAMEF22A3QJZ6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRAMEF22A3QJZ6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRAMEF22A3QJZ6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRAMEF22A3QJZ6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRAMEF22A3QJZ6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRAMEF22A3QJZ6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRAMEF22A3QJZ6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRAMEF22A3QJZ6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRAMEF22A3QJZ6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRAMEF22A3QJZ6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRAMEF22A3QJZ6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRAMEF22A3QJZ6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRAMEF22A3QJZ6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRAMEF22A3QJZ6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRAMEF22A3QJZ6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
PRAMEF22A3QJZ6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRAMEF22A3QJZ6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRAMEF22A3QJZ6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
PRAMEF22A3QJZ6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
PRAMEF22A3QJZ6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRAMEF22A3QJZ6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRAMEF22A3QJZ6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRAMEF22A3QJZ6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRAMEF22A3QJZ6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRAMEF22A3QJZ6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRAMEF22A3QJZ6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRAMEF22A3QJZ6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PRAMEF22A3QJZ6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRAMEF22A3QJZ6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRAMEF22A3QJZ6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRAMEF22A3QJZ6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRAMEF22A3QJZ6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRAMEF22A3QJZ6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRAMEF22A3QJZ6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRAMEF22A3QJZ6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRAMEF22A3QJZ6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRAMEF22A3QJZ6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRAMEF22A3QJZ6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRAMEF22A3QJZ6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRAMEF22A3QJZ6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRAMEF22A3QJZ6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRAMEF22A3QJZ6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRAMEF22A3QJZ6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRAMEF22A3QJZ6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRAMEF22A3QJZ6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRAMEF22A3QJZ6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRAMEF22A3QJZ6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRAMEF22A3QJZ6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRAMEF22A3QJZ6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRAMEF22A3QJZ6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRAMEF22A3QJZ6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PRAMEF22A3QJZ6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PRAMEF22A3QJZ6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PRAMEF22A3QJZ6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PRAMEF22A3QJZ6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRAMEF22A3QJZ6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRAMEF22A3QJZ6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRAMEF22A3QJZ6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRAMEF22A3QJZ6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRAMEF22A3QJZ6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRAMEF22A3QJZ6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRAMEF22A3QJZ6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PRAMEF22A3QJZ6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRAMEF22A3QJZ6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRAMEF22A3QJZ6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRAMEF22A3QJZ6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PRAMEF22A3QJZ6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRAMEF22A3QJZ6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRAMEF22A3QJZ6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRAMEF22A3QJZ6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRAMEF22A3QJZ6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRAMEF22A3QJZ6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRAMEF22A3QJZ6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRAMEF22A3QJZ6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRAMEF22A3QJZ6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRAMEF22A3QJZ6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
PRAMEF22A3QJZ6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRAMEF22A3QJZ6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRAMEF22A3QJZ6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRAMEF22A3QJZ6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRAMEF22A3QJZ6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRAMEF22A3QJZ6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRAMEF22A3QJZ6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRAMEF22A3QJZ6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRAMEF22A3QJZ6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.2 ms