Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 PTMA-204ENST00000409683 933 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 AL445218.1-202ENST00000427695 845 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 AC068987.2-201ENST00000565518 896 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 AC130324.2-201ENST00000580873 638 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 KRTAP4-1-202ENST00000620667 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 AC002076.1-201ENST00000435257 527 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 AC097487.1-201ENST00000514134 934 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 AC080011.1-201ENST00000552378 989 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 ACYP1-204ENST00000555135 639 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LHX6Q9UPM6 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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