Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms