Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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