Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms