Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms