Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms