Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG9BQ674R7 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG9BQ674R7 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG9BQ674R7 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG9BQ674R7 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG9BQ674R7 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG9BQ674R7 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG9BQ674R7 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG9BQ674R7 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG9BQ674R7 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG9BQ674R7 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG9BQ674R7 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG9BQ674R7 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG9BQ674R7 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG9BQ674R7 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG9BQ674R7 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG9BQ674R7 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG9BQ674R7 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG9BQ674R7 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG9BQ674R7 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG9BQ674R7 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG9BQ674R7 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG9BQ674R7 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG9BQ674R7 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG9BQ674R7 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG9BQ674R7 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG9BQ674R7 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG9BQ674R7 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG9BQ674R7 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG9BQ674R7 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG9BQ674R7 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG9BQ674R7 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG9BQ674R7 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG9BQ674R7 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG9BQ674R7 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms