Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms