Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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SNAPC1Q16533 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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SNAPC1Q16533 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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SNAPC1Q16533 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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SNAPC1Q16533 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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SNAPC1Q16533 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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SNAPC1Q16533 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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SNAPC1Q16533 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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