Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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