Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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