Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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BNIP1Q12981 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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BNIP1Q12981 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BNIP1Q12981 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BNIP1Q12981 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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