Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCB1Q12824 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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