Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms