Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms