Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms