Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CD247P20963 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CD247P20963 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CD247P20963 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CD247P20963 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CD247P20963 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CD247P20963 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CD247P20963 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CD247P20963 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CD247P20963 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CD247P20963 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CD247P20963 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CD247P20963 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CD247P20963 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CD247P20963 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CD247P20963 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CD247P20963 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CD247P20963 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CD247P20963 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CD247P20963 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CD247P20963 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CD247P20963 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CD247P20963 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CD247P20963 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CD247P20963 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CD247P20963 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CD247P20963 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CD247P20963 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CD247P20963 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CD247P20963 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CD247P20963 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CD247P20963 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CD247P20963 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CD247P20963 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CD247P20963 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CD247P20963 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CD247P20963 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CD247P20963 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CD247P20963 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CD247P20963 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CD247P20963 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CD247P20963 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CD247P20963 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CD247P20963 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CD247P20963 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CD247P20963 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CD247P20963 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CD247P20963 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CD247P20963 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CD247P20963 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CD247P20963 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CD247P20963 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CD247P20963 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CD247P20963 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CD247P20963 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CD247P20963 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CD247P20963 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CD247P20963 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CD247P20963 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CD247P20963 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD247P20963 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD247P20963 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD247P20963 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD247P20963 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD247P20963 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD247P20963 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD247P20963 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD247P20963 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD247P20963 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD247P20963 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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CD247P20963 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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CD247P20963 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CD247P20963 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD247P20963 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD247P20963 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD247P20963 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD247P20963 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD247P20963 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CD247P20963 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD247P20963 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD247P20963 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD247P20963 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD247P20963 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD247P20963 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD247P20963 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD247P20963 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD247P20963 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD247P20963 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD247P20963 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD247P20963 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD247P20963 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD247P20963 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD247P20963 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD247P20963 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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