Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRHP20396 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRHP20396 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRHP20396 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRHP20396 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRHP20396 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRHP20396 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRHP20396 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRHP20396 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRHP20396 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRHP20396 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRHP20396 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRHP20396 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRHP20396 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRHP20396 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRHP20396 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRHP20396 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRHP20396 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRHP20396 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRHP20396 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRHP20396 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRHP20396 HNRNPA1P59-201ENST00000430583 918 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRHP20396 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRHP20396 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRHP20396 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRHP20396 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRHP20396 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRHP20396 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRHP20396 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRHP20396 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRHP20396 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRHP20396 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRHP20396 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRHP20396 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRHP20396 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRHP20396 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRHP20396 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRHP20396 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRHP20396 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRHP20396 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRHP20396 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRHP20396 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRHP20396 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRHP20396 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TRHP20396 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRHP20396 OR2T27-201ENST00000344889 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRHP20396 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRHP20396 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRHP20396 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRHP20396 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRHP20396 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRHP20396 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRHP20396 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRHP20396 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRHP20396 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRHP20396 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRHP20396 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRHP20396 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRHP20396 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRHP20396 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRHP20396 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRHP20396 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRHP20396 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRHP20396 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRHP20396 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRHP20396 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRHP20396 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRHP20396 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRHP20396 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRHP20396 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRHP20396 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRHP20396 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRHP20396 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRHP20396 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRHP20396 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRHP20396 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRHP20396 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRHP20396 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRHP20396 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRHP20396 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRHP20396 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRHP20396 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRHP20396 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRHP20396 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRHP20396 CRCT1-201ENST00000368790 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRHP20396 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRHP20396 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRHP20396 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRHP20396 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRHP20396 ITGB5-AS1-201ENST00000495917 460 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRHP20396 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRHP20396 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRHP20396 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRHP20396 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRHP20396 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRHP20396 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRHP20396 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRHP20396 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRHP20396 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRHP20396 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms