Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB6P18564 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms