Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGB3P05106 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms