Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APODP05090 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APODP05090 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APODP05090 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APODP05090 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APODP05090 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APODP05090 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APODP05090 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APODP05090 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APODP05090 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APODP05090 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APODP05090 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APODP05090 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APODP05090 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms