Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms